Добрый день, я девопс и начинающей бекенд) Да, я понимаю, что такое код)
Но еще я понимаю, что такое фентези и что теории заговора могут охуенно сильно въедаться в голову людям.
Я выбираю вариант "это sci-fi подоплека возможности Нео взаимодействовать с Матрицей" вместо "все хуйня, вот есть теория по секретным документам".
Не ищите в сюжете идеальности во всем - он уже дает довольно много. Как бы смотря на прочие поделия Вачовски, можно смело предположить, что и в матрице они просто могли дать дуба в каких-то моментах.